Пробудившийся ото сна легендарный ледяной покемон Кюрэм готовится обрушить на Юнову свою ужасающую мощь. Одолев в сражении отряд покемонов «Мечников справедливости», он даёт возможность сбежать одному из них — Кельдео. Скитаясь в поисках укрытия от грядущего бедствия, Кельдео натыкается на надёжных тренеров: Сатоши, Дента и Айрис. Это даёт Кельдео так необходимый ему шанс на реванш с ледяным монстром. И даже, возможно, победу на ним.

Пикачу и его друзья должны спасти потерявшегося Тогепи.

Жадный коллекционер покемонов Гелардан стремится поймать Лугию, чтобы пополнить свою коллекцию. В качестве приманки для своей основной цели Гелардан тревожит и ловит Запдоса, Артикуно и Молтреса — легендарных покемонов-птиц, управляющих элементами молнии, льда и огня соответственно. Из-за этого природный баланс на Земле рушится, и жизнь на планете зависит от того, смогут ли таинственный «избранный» и Лугия объединить свои силы в попытке исправить сложившееся положение.

Мальчик по имени Сатоши отправляется в поездку, чтобы стать мастером покемонов, с его первым покемоном Пикачу. В его путешествии к нему присоединяется Такэши — одержимый девочками горный тренер покемонов, и Касуми — пацанка, водный тренер покемонов, которая, возможно, влюблена в первого.Сатоши с командой проезжают различные области, включая Канто, Оранжевые острова и Дзёто, и затем принимают там участие в «Лиге покемонов».По пути они сталкиваются с обособленной организацией под названием «Команда-ракета», в которую входят трое воров покемонов Мусаши, Коджиро и Мяут. Каждый раз злобное трио пытается наворотить дел, но благодаря Сатоши и его покемону их попытки заканчиваются провалом.