Одногодичная война подходит к концу. Потерпев поражение на Земле, силы Зеона отступают. Амуро Рэй узнаёт больше о своих Ньютайп-способностях и пытается использовать их. Ему суждено вновь столкнуться со злейшим врагом, Чаром Азнаблем, который тоже является Ньютайпом. Грядёт великая битва, близкие люди снова в опасности. Сможет ли Федерация Земли победить Герцогство Зеон, или они потерпят неудачу? Докажет ли Амуро, что он лучший Ньютайп?

79-й год Вселенского Века. Девять долгих месяцев длится изнурительная война между Земной Федерацией и Герцогством Зион. На космической колонии Грин Ноа, входящей в состав Стороны-7, группы самых удалённых от Луны колоний, учёными Федерации завершены опытные образцы новых мобильных доспехов серии Гандам. И вдруг следует внезапное нападение войск Зиона. Во время битвы пятнадцатилетний Амуро Рэй активирует один из мобильных доспехов Федерации, и с этого момента в ожесточённом бою ему предстоит защитить своих друзей с крейсера "Белая База" от бесчисленных атак солдат Зиона, пытающихся любой ценой уничтожить новое оружие землян. Имеет ли Амуро способности пилота? Сможет ли он превзойти зионского аса майора Чара Азнабля? А вдруг он и есть один из таинственных ньютайпов, о появлении которых так много говорилось?

Год 0079 Вселенского Века. Человечество в связи с перенаселённостью Земли вынуждено эмигрировать на космические колонии, называемые Стороны. Сторона-3, провозгласив себя суверенным Герцогством Зеон, объявляет войну Земной Федерации. В то же время Амуро Рэй обнаруживает Гандам, секретное оружие Земной Федерации, способное изменить исход войны. С этих пор Амуро и экипаж крейсера «Белая база» должны противостоять Зеону для того, чтобы закончить войну.