Время действия - далекое будущее. На дворе, вернее за иллюминатором 4767 год. Технологии сделали огромный прорыв - космические путешествия, червоточины, все это стало рутиной для здешних жителей. Но сказка не может длиться вечно. На Землю пришли они - Гнозис, враждебные существа, целью которой является полное уничтожение человечества. Прошло 14 лет с того дня, дня о котором никто не хочет вспоминать, но без прошлого не может быть и будущего..

Ватикан — святая земля католиков. И на этой земле создана организация, сотрудники которой разъезжают по всему миру, проводя тщательные расследования необычных явлений и событий, доказывая или опровергая их «чудесную» суть. Организация эта известна как «Коллегия святых», и расследованиями занимаются входящие в ее состав священники. Перед нами предстанут двое представителей организации, напарники по расследованиям и хорошие друзья: Роберт Николас, эксперт по древним текстам и криптоанализу, и Йозеф Ко Хирага, гениальный ученый. Совместными усилиями блистательный дуэт изучает достоверность чудес, а то и раскрывает обман и преступления, стоящие за ними.

Конфликт на Среднем Востоке сталкивает интересы двух таинственных организаций, вооруженных новейшим оружием массового поражения. Однако даже в том мире, где человекоподобные боевые роботы — реальность, самая серьёзная опасность таится в человеческом разуме.Юсиро, младший сын могущественной и загадочной семьи Гова, один из лучших пилотов-испытателей боевых машин, участвует в эксперименте семьи — ритуальном танце призыва древнего божества Гасараки. Во время танца у него случается видение — загадочная девушка просит остановиться и не призывать этот "ужас" вновь. В замешательстве, Юсиро прекращает ритуал. В тот же момент, на другом конце света некая организация также проводит свой эксперимент, с девушкой по имени Михару.В разразившемся конфликте, затрагивающем мировую экономику и геополитику, Юсиро предстоит узнать тайны своей семьи и культа Гасараки, встретиться с Михару и найти ответы на многие вопросы, главный из которых — кто же он сам?

С развитием науки человечеству открылись знания о существовании магии, что повлекло огромные изменения во всём мире. Однако мальчик по имени Тота, живущий в небольшом городке, далёк от этих изменений. И всё же его обычная жизнь не лишена собственной магии. Поддержку в изучении этого навыка он получает от своей учительницы и друзей. Но тихие деньки заканчиваются, и юношу ждёт удивительное приключение.

Потеряв в войне большую часть своих участников, Правительству Земной Федерации ничего не остаётся, кроме как воссоздавать себя заново. Так, Брайан Мидкрид, председатель Объединённых Колоний, занимает теперь пост президента. Во время срочного собрания Федеративного парламента, он публично признаёт существование инопланетян, а также раскрывает обществу события, произошедшие во время кампании «L5». Его речь в дальнейшем получит название «Токийская декларация», в которой президент настаивает на том, что существование инопланетян — главнейшая угроза для человечества.

В отдалённом будущем Япония превращена в бесплодный край. В Великой пустыне Канто разбросанные по небольшим поселениям люди изо дня в день с трудом выживают в окружении раскалённого песка. Путешествовать на дальние расстояния без специального снаряжения просто невозможно… В этих условиях зарабатывает себе на жизнь невысокий человек по прозвищу Сунабозу — наёмник и охотник за головами. Подобно демону пустыни, его, кажется, невозможно победить. И всё же, как и все мужчины, он имеет некоторые слабости к противоположенному полу…

2225 год. Кодзи Айба и Аой Хосэн проходят курс обучения астронавтов на космической станции «Либе Дельта», расположенной на краю моря Гедальта. Море Гедальта — это странное поле, которое, подобно нервной сети, связывает планеты, но уничтожает любой корабль, зашедший туда слишком далеко.Внезапное нападение разрушает мирную жизнь станции. Неизвестные злоумышленники отправили «Либе Дельту» в глубину Гедальта. В попытке предотвратить погружение станции все инструкторы погибли, а немногочисленные выжившие студенты, в том числе и Кодзи с Аой, эвакуировались на космическом крейсере «Ривиас». Теперь они пытаются найти путь домой, преодолевая опасности космоса, многочисленные трения внутри коллектива и атаки диверсантов, зачем-то продолжающих преследовать корабль.

Ёсукэ Кадомацу с детства мечтал служить на боевых кораблях, как его отец - крупный чин японского ВМФ. Отец привил парню чувство уважения к военному прошлому Японии, несмотря на официальный пацифизм. Уже во время учёбы в Военной Академии Ёсукэ с трепетом посещал храм в честь знаменитого адмирала второй мировой войны Ямамото, спланировавшего Пёрл-Харбор. В дальнейшем блестящий молодой офицер Кадомацу с двумя своими товарищами направляется на элитный эсминец «Мирай», оснащённый ультрасовременной системой Aegis, посредством мощного радара способной перехватывать вражеские ракеты. «Мирай» вместе ещё с тремя кораблями отправляется на совместные с флотом США манёвры под Гаваями. Но во время плавания в районе атолла Мидуэй (места крупнейшего японо-американского морского сражения 1942 года) случилось непредвиденное. Вопреки всем прогнозам синоптиков, флотилию неожиданно настигает мощный шторм, окрасивший небеса в зловещий цвет. В «Мирай» попадает разряд молнии, парализовавший на время все системы связи, после чего корабль окружила странная зелёная аура. Приборы связи вновь заработали и сообщили потрясающую весть - эсминец окружён сорока кораблями, не отвечающими на запросы! И самое поразительное - в гигантском судне впереди по курсу шокированные моряки узнают флагман покойного адмирала Ямамото линкор «Ямато», потопленный американцами в апреле 1945 года. Когда потрясение проходит, японцы понимают, что совершили скачок во времени и попали в самую гущу Мидуэйской битвы. Изменят ли моряки «Мирай» ход истории?

Спустя три года после событий первого сезона война Империи Abh с Конфедерацией человечества идет в полном разгаре.Лафиль, завершив стажировку и достигнув ранга капитана, получает под командование только что сошедший с верфи штурмовой корабль Басройл. Не забывает она и о Дзинто, к тому времени как раз закончившего академию и ставшего офицером поддержки, и по праву капитана корабля Лафиль запрашивает его перевод под своё командование.Первая же их миссия оказывается смертельно опасной: флоту Abh, к которому приписан Басройл, поручено защитить Врата в Плоскость около удаленной планеты. Ко вратам с другой стороны приближается флот Конфедерации в количестве, пятнадцатикратно превосходящем флот Империи. И что хуже всего, флотом Abh командуют офицеры из рода Бибос, известных своим эксцентричным, и часто безумным поведением.

Благодаря сокрушительному успеху флота Abh под командованием братьев Бибос Империя за короткий промежуток времени захватывает множество обитаемых миров и сталкивается с проблемой нехватки наместников для новых территорий.Лафиль назначают на должность Наместника Планеты Лобнасс II.Прибыв на планету, Лафиль с Дзинто обнаруживают, что Объединенное человечество использовало Лобнасс II как планету-тюрьму. Население планеты в 1 миллион человек живет на единственном острове среди бескрайнего океана.Вскоре на планете вспыхивает восстание заключенных, и Дзинто захватывают в заложники. Одновременно с этим к Вратам в звездную систему прибывает огромный флот Конфедерации, и у Лафиль не остается иного выбора, кроме как бросить Дзинто на планете на произвол судьбы...

В 2005 году раса инопланетных монстров, называемых Зондерами, вылезает из-под земли и начинает серию атак на Токио. Единственная защита от этих созданий — секретное агентство «Бесстрашные защитники Земли» (англ. Gutsy Geoid Guard) и их секретное орудие — гигантский робот Гаогайгар.Пилот Гаогайгара — Гай Шишио, бывший астронавт, который чуть не погиб два года назад, когда Зондеры впервые напали на землян. Его жизнь была спасена загадочным роботом-львом Галеоном, который вытащил его из горящего шаттла и вернул на Землю. Отец Гая, Лео, использовал технологии Галеона, чтобы восстановить своего полумёртвого сына в качестве киборга, надеясь, что тот сможет остановить инопланетян, когда они появятся. И теперь, с Галеоном в качестве ядра, Гаогайгар борется за защиту Земли. В этом ему помогают команда трансформирующихся роботов и мальчик по имени Мамору Амами, который обладает способностью очищать ядра Зондеров и который, судя по всему, как-то связан с загадочным Галеоном.

После победы «Бесстрашных защитников галактики» (англ. Gutsy Galaxy Guard, сокр. GGG или 3G) над Империей Зондер и Тридцать одним первобытным, над Землёй нависает новая угроза. Агентство GGG (включая Гая Шишио и свежесконструированного Гаофайгара) объединяется со своим французским аналогом, агентством «Егерь» (фр. Chasseur), чтобы сражаться со злой организацией «БиоНэт». Среди сотрудников «Егеря» числится и Рене Кардифф-Шишио, бывший киборг «БиоНэта», чьё желание уничтожить всех, кто забрал её человечность, нисколько не ослабло.В то время как GGG и «Егерь» воевали с «БиоНэтом», базы «Бесстрашных» по всему миру подверглись внезапным атакам. Мало того, Мамору Амами, которого похитила и клонировала злодейская организация «Одиннадцать королей сола», выкрал недавно открытые Q-части и оригинальные гао-машины. Изгнанные с Земли Организацей Объединённых Наций, GGG теперь должны отправиться на край галактики, чтобы сразиться с «Одиннадцатью королями сола» и спасти Мамору, пока ещё не поздно.