Нацуми Ягами, страстно увлекающаяся косплеем школьница, попала в некий ритуал вместе с командой девочек-волшебниц. В результате люди исчезли, в мире появились чёрные башни-печати, а Нацуми стала обладательницей браслета девочки-волшебницы. Появившаяся принцесса Такицу объявила, что лишь уничтожение возникших после ритуала башен, охраняемых монстрами, вернёт на Землю мир и порядок.

С победы над арагами прошло два года. С тех пор они больше не появлялись. ЗЦУ распущена, а её члены разбежались кто куда. Япония давно уже восстановилась от разрушений и живёт дальше. А вот в отношениях Момидзи и Мамору сплошной разлад, и они всё больше отдаляются друг от друга. Но всё меняет красноволосая красотка Валенсия Татибана, прибывшая за помощью из Сан-Франциско, где вновь дают о себе знать арагами. Старая команда из ЗЦУ собирается вместе снова, чтобы дать отпор новой угрозе и узнать, кто же стоит за всем этим.

Гонка вооружений достигает поразительного развития, теперь оружие — с головой, руками, ногами и очень женственными органами! Да, в академии Сэйсё каждая девушка, буквально, смертоносное оружие, и все они хотят быть лучшими у своих личных наставников!Излишне говорить, что вновь прибывшему инструктору Гэнкоку будет нелегко к этому привыкнуть. Нужно приспособиться к работе с живым арсеналом, милашками с большим калибром и сложными именами: FNC (Функо), M16A4 (Итироку), L85A1 (Эл) и SG550 (Зиг). Тем более, что все они имеют спусковой крючок, и нет такого бронежилета, который может остановить действительно решительную студентку! Ему придётся переписать руководство по отношениям студентов/преподавателей и молиться, чтобы в его должностные инструкции не была включена необходимость разбирать и собирать одну из своих курсанток в темноте. Но, к сожалению (для него), Функо уже думает о том, чтобы стать его личным оружием, и она обычно получает то, что хочет!

Вступив в клуб журналистики, Юки Акамацу опомниться не успел, а президент клуба Аяка Никайдо уже попросила его стать ответственным за колонку советов. В настоящее время на вопросы, присланные страждущими читателями, ответы дают три девушки: Рино Эндо из научного класса, Фуми Кудзё из литературного класса и Икуми Судзуки из спортивного класса. Проблема в том, что у трёх непохожих девушек и взгляды на жизнь совершенно различные. Как же им прийти к согласию и осчастливить читателей? Что ж, и на этот вопрос должен найтись ответ.

Специальный фансервисный эпизод, вышедший на Blu-ray в комплекте с 4 томом манги, в котором знакомая нам четвёрка девушек-винтовок отправилась в поход с ночёвкой на речной пляж, чтобы повеселиться перед началом нового семестра.