События разворачиваются в эпоху Бакумацу, в конце правления сёгуната в Японии в середине XIX века. Сёгунат Токугава использует особые, промывающие мозги «Небесные песни», исполняемые главными идолами «Синсэнгуми» в попытке поработить всю страну и её народ. В этой Японии сочинение или исполнение любых песен, кроме «Небесных» — преступление, которое жестоко карается смертной казнью. Сакамото Рёма и другие рокеры восстают, дабы рискнуть изменить мир ради свободы и справедливости при помощи рок-н-ролла.

Аида Мана — девушка, которая всегда стремится сделать что-то ради других. Однажды, когда она посещала «Башню Клевера» по программе её школы, внезапно появился враг, который назвал себя Эгоист, и попытался манипулировать её собственным сердцем! Для борьбы с этим врагом, она обратилась к волшебной фее Шаруру с просьбой превратить её в Pretty Cure! Для защиты мира во всем мире.Вскоре другие легендарные Pretty Cure вступили в бой вместе с ней!

Три года прошло с момента окончания войны между джовианцами и землянами. Акито и Юрика считаются погибшими в крушении шаттла, случившемся годом позже. Малышка Рури Хосино продолжает нести службу, но уже сама командуя Надэсико.Благодаря успешному изучению бозоновых прыжков была начата реализация «Плана Хисаго» — создание обширной сети порталов, окажись которая не в тех руках, и быть беде. Что и происходит, когда сеть внезапно оказывается захвачена террористами «Наследники Марса» во главе с бывшим джовианским офицером, представляющим людей, недовольных итогом войны.Для секретного расследования ситуации прямо в гущу событий отправляется собранная вновь вместе старая команда Надэсико, у которых в пути появляется неожиданный союзник.

Ты знаешь, в какой день умрешь? А Митиру знает... благодаря своей способности видеть на шеях людей «кольца смерти». И чем они темнее, тем ближе тот час.Именно такие, причём совершенно чёрные, «кольца» она видит на двух своих одноклассниках: Тике Акацуки и Сито Татибане. Пытаясь предупредить их об этом, она узнаёт ма-аленький секрет юношей — они уже мертвы! И остаются живыми лишь благодаря контракту с «Зомби-кредит», оплачивать который им предстоит всю жизнь, охотясь и уничтожая зомби. Отныне наша героиня будет помогать им в поисках, не без помощи её способности «Око Синигами».

Академия Кросс — элитная школа с двумя раздельными классами, изолированными друг от друга: Дневным и Ночным. Префектам академии — Юки Кросс и Зеро Кирю — вменяется в обязанность поддерживать порядок между учащимися, когда вечером классы сменяют друг друга. Ночной класс наполнен крайне безукоризненными студентами, считающимися элитой, и добиваться порядка бывает не всегда просто, ведь весь Дневной класс без ума от студентов Ночного. Однако к этому есть жизненная необходимость, учитывая, что эта так называемая элита состоит из вампиров. Юки и Зеро выполняют функцию охранников, защищая секреты Ночного класса и оберегая ни о чём не ведающий Дневной класс.Юки, приёмная дочь ректора академии, берётся за работу серьёзно и с отдачей. Не в последнюю очередь потому, что именно это позволяет ей взаимодействовать с её тайным возлюбленным и спасителем — старостой общежития Ночного класса Канамэ Куран. С другой стороны — Зеро, который питает глубоко укоренившуюся ненависть к вампирам и на данном этапе не остановится даже перед убийством…Смогут ли люди и вампиры сосуществовать хотя бы в строгих установлениях Академии Кросс? Только время знает ответ.

Второй фильм-кроссовер во франшизе «Pretty Cure Stars», в котором участвуют все действующие персонажи «Pretty Cure» из фильма «Mahou Tsukai Pretty Cure»!