Аниме рассказывает о девочке по имени Рицуко Ханаути, которая с детства не могла ходить, и о её первых шагах на пути в жизнь. История начинается с первого похода девочки в школу. Мечты Ханаути о сотне друзей рассыпаются в один миг — для одноклассников она становится «белой вороной». Сможет ли Рицуко вытерпеть издевательства и стать частью коллектива?
Мальчик по имени Хосино Тэцуо хочет жить вечно. Но если он хочет жить вечно, ему нужно получить механическое тело. Для того чтобы его получить, он отправляется на поезде в космическое пространство вместе с Мэйтел, загадочной и прекрасной женщиной (поезд называется Галактический экспресс 999). Сериал, в котором с Тэцуо происходят различные приключения и встречи с различными существами, заставляет задуматься о жизненных ценностях.