Распрощавшись с Хидоми, Харуко вновь отправилась навстречу приключениям и опасностям.История расскажет о семнадцатилетней старшекласснице по имени Кана. Она меломанка и целыми днями проводит время в окружении подружек: Моссан, Хидзири и Петс. Её жизнь была бы такой же скучной и однообразной, пока в один день с неба не свалился робот вместе с самой Харуко! Наша Мисс Бедствие хочет втянуть Кану и её друзей в «мутную» историю, связанную с некой сущностью, известной как Атомск. Не имея какого-либо выбора, наша героиня рискует всем и ударяется во все тяжкие. И эта безумная история только начинается!

Действия разворачиваются в 2117 году, спустя около полугода после событий фильма «Психопаспорт. Фильм». Бюро Общественной Безопасности расследует странные события, связанные со специальным учреждением для содержания потенциальных преступников под названием «Обитель». С помощью новой комбинации наркотиков и особой терапии в «Обители» удалось создать идеальное общество нового типа, где потенциальные преступники действуют в гармонии друг с другом и выполняют работу, полезную для общества, сохраняя свой коэффициент преступности на удовлетворительном уровне. Однако, когда в здание Бюро врезается автомобиль, управляемый травмированной женщиной — психологом-консультантом, работающем в «Обители», чьё психологическое состояние было повреждено из-за неизвестных наркотиков — становится ясно, что общество, созданное «Обителью», не так идеально, как все считают.

Несмотря на принятие постановления "Билл", вводящего комендантский час для несовершеннолетних и регулирующего доступ в Интернет, молодежь продолжает бороться за свою свободу, используя разные методы. Одна такая группа борцов за свободу находится в Токио. Они называют себя "SIRRUT". Группа решает взять в плен Фумито Нанахару, человека, который имеет большое влияние на политический мир и тайно контролирует Токио. Используя интернет в качестве оружия, группа больше узнает о Фумито и о "Башне", тайной организации, которая занимается экспериментами над людьми.Когда члены "SIRRUT" попытались устроить засаду в метро с целью разоблачить "Башню", загадочные существа вдруг появляются и нападают на пассажиров. Во время этой бойни появляется Сая - молодая девушка, которая использует катану, чтобы убить монстров. Это та самая Сая, которая многое потеряла после ужасающих происшествий в провинции Укасима. Какие эксперименты проводят Фумито и "Башня", и сможет ли Сая отомстить Фумито?Финальная битва начинается!

При трагических обстоятельствах узнав об истинной природе «Сивиллы», инспектор Аканэ Цунэмори принимает решение подчиниться системе, искренне веря, что в конце концов человечность и правопорядок смогут сосуществовать в гармонии.После дела Сёго Макисимы и исчезновения Синъи Когами суматоха в департаменте утихла, и город вернулся к прежней размеренно управляемой жизни. Инспектор Цунэмори теперь — член нового подразделения полиции, а преследование и задержание преступников для неё отныне привычное дело. Казалось бы, жизнь вернулась в свою колею, но Аканэ пока не подозревает, что скоро она столкнётся с настоящим чудовищем, которое сотрясёт Систему до самого её основания...

События сериала разворачиваются после последнего фильма из трилогии «Грешники системы». В новосформированный Первый оперативный отдел Бюро Общественной Безопасности приходят инспекторы Арата Синдо и Кэй Михаил Игнатов, имеющие скрытые мотивы для поступления на службу. В это же самое время Япония начинает изменять внутреннюю и внешнюю политику, вполне возможно, под влиянием неких третьих сил...

События происходят летом 2112 года, перед тем как Аканэ Цунэмори была назначена инспектором первой группы отдела уголовных расследований Бюро Общественной Безопасности. Тэппэй Суго, опытный пилот пятнадцатой объединённой оперативной группы Вооружённых сил, присоединяется к военной операции на острове Окинава. Тремя месяцами позднее беспилотный боевой дрон открывает огонь по Министерству обороны в Токио.Исполнитель первой группы отдела уголовных расследований Бюро Общественной Безопасности Томоми Масаока отправляется на военную базу Суго, чтобы расследовать происшествие в Токио.

Дополнительный эпизод, основанный на сюжете тридцать седьмой главы оригинальной манги «Баскетбол Куроко» и выпущенный в комплекте с 25-м томом.

События разворачиваются в январе 2118 года: Аканэ Цунэмори, выполняя обязанности главного инспектора Бюро общественной безопасности, получает информацию об инциденте, произошедшем на иностранном судне. Аканэ и Ацуси Синдо, руководитель отдела статистики Министерства здравоохранения и социального обеспечения, торопятся на место события, однако по неизвестным причинам полномочия по расследованию передаются Исполнительному отделу бюро по координации действий за рубежом Министерства иностранных дел.На корабле тем временем обнаружена мертвой Доктор Милиция Стронская, которую Ацуси пригласил на встречу в качестве гостя. За инцидентом стоит организация "Нарушителей мира", которую Исполнительный отдел преследовал на протяжении долгого времени. Первый отдел департамента уголовного розыска выясняет, что инцидент вызван "Нарушителями мира", которые нацелились на исследование доктора Стронской, известное как "Документ Стронской", и создает команду для совместного расследования с Департаментом поведенческих расследований. Там они встречают Шинью Когами, бывшего беглеца из Бюро общественной безопасности. При помощи Дзёдзи Сайги, последнего, кто общался с доктором Стронской, команда отправляется в Дэдзиму для получения документа. Аканэ и Когами сталкиваются с неожиданно крупным делом, связанным с "документом Стронской".Скрытая истина, способная потрясти японское правительство и систему "Сибилла", впервые будет раскрыта. Это нерассказанная история — связующее звено между "Психопаспорт: Грешники системы — По ту сторону царства" и "Психо-Пасс 3".