В одном из мегаполисов Японии, где жизнь течёт стремительно и благополучно, произошло необъяснимое: пропало всё население города. Это событие ставит правительство страны на уши.Парень Такуя — одинокий курьер, работающий по контракту на исследовательскую организацию. Однажды он встречает девушку Юки, которая является единственной выжившей после того инцидента. Она считает, что происшествие как-то связанно с посланием её отца, который тоже бесследно пропал. Парочка решает отправиться в тот город-призрак и разузнать тайну пропажи горожан.Однако не всё так просто. На пути расследования им повстречаются не только препятствия в виде заговоров секретных организаций, но и столкновение с призраками давно ушедших из жизни людей, которые всё ещё обитают в этом месте.

Прошёл год с того момента, как Сироэ вместе с несколькими тысячами игроков оказался заперт в популярной ММОРПГ-игре Elder Tale. Заручившись поддержкой друзей и других игроков, Сироэ создал орган местного самоуправления «Круглый стол» и добился мира и порядка в Акибе, городе игроков-авантюристов. За это время игроки смогли наладить отношения с людьми, которые всегда были в этом мире. К сожалению, благополучное время продлилось недолго: стали появляться новые сильные чудовища, которые способны заходить в Акибу. Аристократы грызутся за власть, а среди игроков крепнут разногласия, и вот уже «Круглый стол» под угрозой.

История разворачивается в мире, который смог достичь больших успехов в области развития технологий и компьютерных сетей, а также открыть архипелажную нацию Кремона.Вот в таких условиях обычному парню Коку, который учится изготавливать скрипки, и легендарному следователю королевской полиции RIS Киту предстоит разобраться с таинственной преступной организацией. Однако, помимо преступной группировки, городу угрожает нечто не менее страшное, а именно череда таинственных и жестоких серийных убийств, на месте которых можно обнаружить подпись убийцы «Би», чью личность, а также цель преступлений и необходимо будет раскрыть героям.

Еще одно дополнение к франшизе «Призрак в доспехах», рассказывающее о появлении Девятого отдела МВД Японии.Отдел занимается различного рода расследованиями, которые не под силу вести полиции. Мотоко Кусанаги — майор, в детстве перенесшая многочисленные операции по кибернетизации тела и ставшая полноценным киборгом — оказывается под командованием Дайсукэ Арамаки, чтобы расследовать дело о взрыве бомбы. Однако помимо нее, Арамаки привлек к делу еще одного подозрительного человека, ветерана и экс-рэйнджера, по чьей вине случилось множество различных кровавых конфликтов в Южной Америке — Бато, и детектива Тогуса. Это послужило началу формирования Девятого отдела. Вместе эта троица должна дать отпор всем террористам.