Старшая школа организовала учебный лагерь в пансионате у моря, где подростки будут под присмотром Ёсихиро Мацунаги, красавчика с грустными глазами. Именно на этом пляже семь лет назад возлюбленная распрощалась с Ёсихиро и исчезла, словно мимолётное видение. С тех пор молодой человек так и не смог отойти от расставания, предавшись глубокой печали.Несмотря на тяжесть воспоминаний, Ёсихиро завёл дружбу со своей подопечной Нао Морисавой, и между ними зародились доверительные отношения. Как оказалось, девушка живёт с похожим душевным грузом, опутавшим её юное сердечко шипами роз: год назад в авиакатастрофе погиб её возлюбленный. При этом молодые люди не замечают, что за ними постоянно приглядывает загадочная девочка, которая словно чёртик из табакерки раз за разом оказывается рядом с ними и также внезапно пропадает. Возможно, именно эта всезнающая таинственная малышка поможет им залечить душевные раны, отпустить прошлое и начать нормальную жизнь.
Во время холодной войны Морские силы самообороны Японии совместно с ВМС Соединенных Штатов Америки в режиме строжайшей секретности и военной тайны разработали атомную подводную лодку «Sea Bat», аналогов которой в мире не существовало. Официально АПЛ входила в состав 7-го флота США, однако экипаж лодки состоял сплошь из японцев, да и капитаном был выбран Сиро Кайэда — опытный и заслуживающий доверия офицер.Тем не менее, отправившись в свой первый рейс, капитан «Sea Bat» провозглашает подводную лодку независимым государством, «Ямато», и намекает об имеющемся у неё на борту ядерном оружии. И теперь за Кайэдой и «Ямато» начинается самая настоящая охота, тогда как на кону стоят будущее японского правительства и возможность дискредитации репутации США.
Из-за маленького роста Юкинари Сасаки постоянно задирали и обижали девчонки. По этой причине у него выработался необычный рефлекс: когда девушки трогают его или даже просто подходят близко, его кожа покрывается пятнами, как от крапивницы. Внезапно он оказался перемещён в город Сэйрэн, находящийся в загадочном невидимом мире, который вращается вокруг Земли. Этот город населён огромным количеством женщин и всего несколькими мужчинами. К счастью для нашего героя, его новая знакомая Михару по каким-то необъяснимым причинам не вызывает у него аллергии.
