История сосредоточена на Наю, ученице средней школы, которая потрясла своих одноклассников тем, что в первый же день нового учебного года пришла в школу в черных кружевных трусиках. Она любит этот вид нижнего белья и пытается «ввести моду на него» с помощью клуба нижнего белья среди ее одноклассниц, которые беспокоятся о том, какое белье им лучше выбрать.

«Двигатель воплощения», революционное изобретение в области энергетики, навсегда решил проблему с энергией для этого мира. Хотя некоторые социальные проблемы ещё не до конца решены, это изобретение сделало мир лучше и позволило людям достичь благополучия.Аканэ Иссики живёт вместе с дедом-изобретателем и младшей сестрёнкой Момо недалёко от Голубого Острова, где находится двигатель. Ей приходится самой вести домашнее хозяйство, так как дедушка всё время занят своими странными изобретениями, а от Момо пока мало толку.Но, однажды, в мир приходит беда. Неизвестные создания «одиночки» пытаются похитить «Двигатель воплощения». Против врага не помогают никакие силы. Но на сторону человечества встаёт девушка в ярко-красном «палитра-костюме», который придаёт ей невероятную силу. Вместе со своими подругами она должна остановить «одиночек» и защитить мир.И как же с этим связана Аканэ Иссики?

Спустя десять лет Шин и Джун Канзато возвращаются в Аянаги, небольшой прибрежный городок, где живёт их старший брат Рё, шеф местной полиции. В это же время происходит ряд загадочных случаев: экипаж подводной лодки исчезает прямо во время погружения, синдром апатии вновь проявляет себя через десятилетие, в придачу к этому обнаруживается тело старшеклассника, вывернутое практически наизнанку!Рё находит следы людей, как-то связанных с этим, и полностью уходит в работу, игнорируя младших братьев. Шину снятся странные сны, и в итоге, попав в выходящие за все рамки обстоятельства, когда ему угрожает опасность, он пробуждает в себе нечто, называемое «Персона».

С завершением Фрактала — системы управления миром, человечество наконец-то впервые в истории добилось рая на Земле, где для жизни не надо прилагать никаких усилий. Всю рутинную работу за людей выполняют их аватары, а сами люди могут заниматься всем, чем душе угодно.Теперь, спустя тысячу лет после активации Фрактала, система все еще действует, однако в живых не осталось никого, кто бы понимал, как она работает, а обслуживающим персоналом теперь являются служители Храма, больше похожего на культ. Подавляющее большинство людей искренне верит в то, что сохранность системы — единственное, что нужно для счастливой и беззаботной жизни.Главный герой истории, парень по имени Клейн, живет обычной бесцельной жизнью. Но однажды он помогает Фрине, беглой жрице Фрактала, спрятаться от неизвестных преследователей. Впрочем, вскоре Фрина исчезает, оставив Клейну странный кулон. Клейну удается расшифровать спрятанные в нем данные и активировать кулон, который после активации превращается в девочку-аватара по имени Несса.Так Клейн и Несса отправляются в путешествие, в котором им предстоит найти Фрину, повстречать людей из группировки «Потерянное тысячелетие» и узнать правду о Фрактале.

События сериала разворачиваются в 311 году по Орбитальному календарю, когда человечество переселилось с Земли на космические колонии.Одним погожим деньком жительнице «элитной» колонии Кирквуд — девушке по имени Акиха Сисидо — сестра сообщает, что скоро ей предстоит встреться с женихом! Вовсе не обрадовавшись такому «подарку» судьбы, Акиха срочно покидает колонию на небольшом космическом судне. Недолго бороздя просторы космоса, Акиха оказывается в другой колонии, управляемой злобным искусственным интеллектом Леопардом. В борьбе с ним Акиха объединяется с офицером межколониальной полиции Ицуки Каннаги, молчаливой девушкой Хонокой Кавай и с роботом, представившимся как Имоко.

За несколько лет до начала истории астероид Кумария взорвался в глубинах космоса, и его осколки прошлись метеоритным дождём по Земле. В результате этого происшествия по всему миру начали появляться полулюди-полумедведи (человеко-медведи), которые вскоре развязали войну против обычных людей. В этой войне не было пощады никому: человеко-медведи поедали людей, люди расстреливали человеко-медведей, продолжая, казалось бы, бесконечный цикл ненависти и жестокости. Тем не менее, в конце концов между людьми и человеко-медведями возвели гигантскую «Стену вымирания», после чего установилась эпоха мира.Наша история начинается со встречи двух учениц-любовниц академии Арасигаока, Курэхи Цубаки и Сумики Идзумино. Прогуливаясь вместе, они пришли в очень важный для них цветник, где на их глазах расцвела лилия. В ту же секунду раздался сигнал бедствия. Человеко-медведи вторглись в мир людей и напали на последних. Но правда ли это человеко-медведи? Одна загадка за другой. Что ждёт героев в итоге?

Будучи жестоко убитой вместе со своей семьёй, Макина Хосимура становится «сикабанэ-химэ» — живым мертвецом, связанным контрактом с культом Кугон, — с целью отомстить загадочной организации, якшающейся с некромантами, которая несёт ответственность за её смерть. Она задействована в задании вместе с Кэйсэем Тагами, её «священником контракта» и просто другом. В истории также уделяется большое внимание младшему брату Кэйсэя — Ори, смерть для которого имеет странную привлекательность и который очень скоро раскрывает секрет своего старшего брата и втягивается в манящий и загадочный мир «сикабанэ».