Действие фильма разворачивается спустя два года после событий игры Final Fantasy VII. Планета стала довольно мирным местом, хотя города и вся индустрия полностью разрушены, а большая часть населения заражена синдромом "Звездного шрама". Главный герой по имени Клауд живет один и чувствует вину за то, что совершил, спасая мир. Однако рефлексировать ему осталось недолго - миру грозит новая напасть.

С давних времён между империей Нифльхейм и королевством Люцис идёт война. Войска Нифльхейма теснят армию Люциса, несмотря на все старания бойцов элитного подразделения «Кингсглейв», служащих лично правителю Люциса королю Регису и получающих особые силы благодаря древней магии королевского рода. В конце концов от некогда великого королевства остаётся только один город, закрытый магическим щитом, поддерживаемый королём Регисом.В попытках спасти хотя бы этот город король Регис собирается заключить мир с империей и женить своего сына Ноктиса на имперской подданной леди Лунафрейе, принцессе завоёванного Нифльхеймом королевства Тенебре. Но церемония подписания мирного договора проходит совсем не так, как планировалось, и весь груз ответственности за судьбу королевства ложится на плечи бойца подразделения «Кингсглейв» Никса Ульрика.