Со времен событий по «делу Скальетти» прошло четыре года. С тех пор многое в жизни героев изменилось кардинальным образом: шестой мобильный отряд был распущен, но его бойцы по-прежнему служат в Бюро Пространства и Времени. Только капитан Наноха Такамати покинула свой пост, чтобы больше времени уделять приемной дочери Вивио, которой в будущем суждено стать величайшей волшебницей. Вместе со своей лучшей подругой Фейт Наноха изо всех сил старается обеспечить Вивио нормальное счастливое детство, которого им самим так не хватало.

События сериала разворачиваются спустя десять лет после событий, показанных в аниме «Лиричная волшебница Наноха: Ас».Фейт, Хаятэ и прочие из той самой команды теперь работают на постоянной основе в «Бюро пространства и времени». Наноха — боевой инструктор, Фейт занимается специальными расследованиями, а Хаятэ стала офицером управления. И вот снова они должны объединиться, чтобы защитить свой родной мир, а также другие миры, параллельные ему. В сериале представлены и новые персонажи: Субару, Тиана, Каро и Эрио — так что скучать зрителю не придётся. На старт. Внимание. Марш!