История происходит в альтернативном будущем, где Советский Союз не распался, а на земной орбите вращается построенный его стараниями искусственный спутник, который Коалиционное правительство переоборудовало в тюрьму для особо опасных преступников. Неясно от чего и как, но спутник выходит из строя и начинает падать на Землю, а из-за сбоя в электричестве двери камер открываются, и заключённые выходят из анабиоза. Хотя никто из них и не помнит, как очутился здесь, но они едины в желании выбраться с «тонущего корабля».Достаточно занятны и сами личности лиходеев, оказавшихся в западне: девочка-хакер, обвалившая мировую фондовую биржу, брачная аферистка, любящая играть в казино, бывший правительственный инженер, попавшийся на растрате бюджета, старый учёный, проводивший опасные изыскания, со своим котом и таинственный парень, от которого в ответ только и слышишь опостылевшее «ага».Однако постепенно до них доходит, что с тюрьмою они повязаны не только фактом своих пригрешений, а сама станция, как по форме, так и по числам на комнатах и самих арестантах, до ужаса напоминает русскую рулетку, в которой коту отводится сыграть жизненно важную для этой пятёрки нечестивцев роль.

Мир ближайшего будущего расколот войнами, а тут еще на Землю из недр пространства-времени свалились пришельцы-кораллиане. С одной стороны, в атмосфере появилась чудесная трапар-энергия, благодаря которой стало проще летать, с другой – вокруг кораллиан время от времени гремят мощные взрывы, из которых появляются боевые джи-монстры, разрушающие все вокруг. Небольшой остров Ивато, яблоко раздора между Китаем, Японией и ныне свободной Окинавой, 15 лет назад тоже пострадал от монстра, которого уничтожила странная женщина на боевом роботе. Впрочем, местные жители чужестранку с зелеными волосами, мягко говоря, не любили и при первой же возможности сдали спецслужбам. Пожилой доктор, приютивший ее сына, единственный знал имя его матери – Эврика…И вот много лет спустя 13-летний Ао Фукай вместо первого дня в средней школе оказался в гуще событий – джи-монстр снова явился и начал разносить остров. Конечно же, в парне проснулась родовая память, он смог активировать старого робота и разнести врага до прибытия «всей королевской конницы». И снова островитяне отвернулись от него, как от опасного чужака, а компетентные органы окрестных стран, наоборот, очень заинтересовались. Пришлось Ао срочно принять предложение всемирной корпорации «Голубое поколение» и вступать в ее боевой отряд «Крысолов». Ведь для того, чтобы найти мать и ответы на вопросы, молодому бойцу нужны свобода, надежные друзья и верный робот «Нирваш»!

Вскоре после спасения Широ Амада получает обвинение в шпионаже и пособничестве по передаче высококлассного Гандама врагу. Сотруднице разведывательного управления Элис Миллер поручено расследовать инцидент. Задокументированные результаты её расследования, на суде, станут определяющими и решат, является ли Широ предателем и какова его судьба в качестве командира восьмого взвода МС.

Недалёкое будущее. Весь мир охватил смертельный вирус под названием Медуза, превращающий людей в камень. Для того, чтобы избежать ужасной смерти, группа инфицированных людей была погружена в криогенный сон в надежде, что в будущем найдётся способ борьбы с вирусом. Касуми Ишики, как и другие 160 "избранных", отправилась в Центр Гибернации, который находится внутри старинного замка. Хоть девушка и понимает, что это невозможно, Касуми засыпает с надеждой, что когда-нибудь снова встретится со своей сестрой-близнецом Шизуку Ишики, также заражённой вирусом. Когда Касуми и другие люди просыпаются, они замечают, что центр выглядит совсем не таким, каким они его видели перед сном. Как и в истории про "Спящую Красавицу", замок покрылся терниями. Но это ещё не всё ! На проснувшихся нападают невиданные ранее монстры. Сколько же длился их сон ? Откуда появились эти монстры ? Что случилось с миром ?

В 2012 году Японию наводнили Мю — человекоподобные существа с голубой кровью, пришедшие из иного измерения.В 2015 году захватчики атакуют Токио, но отступают под натиском гуманоидного оружия под названием «долем».Во время всей этой неразберихи Аято Камина встречает свою одноклассницу Рэйку Мисиму. В тот же самый день его атакуют люди правительства, но на помощь приходит женщина по имени Харука Сито и сообщает ему, что её послала организация «TERRA», и что Токио был запечатан во временном разрыве, где время бежит лишь с третьей частью той скорости, с какой оно бежит во всём остальном мире. Он скрывается от Харуки и запрыгивает на поезд, где снова встречает Рэйку. Прибыв в Зал Ра, он следует за ней к ужасающих размеров яйцу, из которого вылупился долем Ра-Зефон (англ. RahXephon). Неожиданно появляется мать Аято на вершине долема, остановившего вторжение «TERRA». В битве мать Аято получила ранение, и, увидев её голубую кровь, Аято вместе с Харукой убегают прочь...

2225 год. Кодзи Айба и Аой Хосэн проходят курс обучения астронавтов на космической станции «Либе Дельта», расположенной на краю моря Гедальта. Море Гедальта — это странное поле, которое, подобно нервной сети, связывает планеты, но уничтожает любой корабль, зашедший туда слишком далеко.Внезапное нападение разрушает мирную жизнь станции. Неизвестные злоумышленники отправили «Либе Дельту» в глубину Гедальта. В попытке предотвратить погружение станции все инструкторы погибли, а немногочисленные выжившие студенты, в том числе и Кодзи с Аой, эвакуировались на космическом крейсере «Ривиас». Теперь они пытаются найти путь домой, преодолевая опасности космоса, многочисленные трения внутри коллектива и атаки диверсантов, зачем-то продолжающих преследовать корабль.

Остров Сэнтан, являющийся частью Свободной Зоны, расположен в море Юдэн, — ровно посредине между Северным государством и Южноконтинентальной Свободной Зоной.Главный герой Акиюки Такэхара, по возрасту школьник, живёт на острове вместе со своей матерью по имени Фуса. Так сложилось, что живут они отдельно от отца; Рюдзо работает врачом в городской больнице, но связь между семьёй крепка, и они часто видятся.В один летний день, как обычно занеся Рюдзо завтрак от Фусы, Акиюки спешит на автобусную остановку, боясь опоздать на школьный автобус. Вместе с Хару и его одноклассниками в автобус садится странная беловолосая девушка.Приехав к школе, когда практически все покинули автобус, девушка активирует бомбу. Взрыв разносит автобус и оставляет после себя странное свечение, луч которого пронзает руку Акиюки, вызвав у него страшную боль.Вскоре тело Акиюки трансформируется, и он превращается в причудливое существо КсамД.Мгновения спустя Северное государство начинает атаку на Свободную Зону, используя форманоидное оружие...

Надежда ученицы старшей школы Хитоми Кандзаки на первый поцелуй со своим семпаем улетучивается ровно в тот момент, когда прямо перед ней в столбе света возникает юноша в необычном облачении с мечом наперевес, а в след за ним и огромный дракон. Не без помощи Хитоми дракон был побеждён. Но немногим позже всё тот же таинственный свет переносит её с незнакомцем с Земли в волшебный мир Геи. А чуть позже выясняется, что таинственный мечник - принц Ван Сланзар де Фанел, одержимый идеей объединить страны Геи в борьбе со зловещей империей Зайбах, и решает помочь ему. Во время их опасного, но захватывающего путешествия Хитоми обнаруживает в себе скрытые способности, которые начали давать о себе знать ещё с их первой встречи, а также пытается узнать настоящего Вана за завесами тайн, которыми он себя окружил, о его прошлом и о гигантской машине Эскафлон.