2045-й год. Простая, на первый взгляд, работа по выслеживанию торговца оружием на западном побережье США втягивает группу наёмников ПРИЗРАК, состоящую из бывших членов Девятого отдела Бюро общественной безопасности Японии, в конфликт с невиданной доселе угрозой — постлюдьми, существами, значительно превосходящим киборгов. Члены Девятого отдела собираются вместе, чтобы противостоять этой новой угрозе.

Шестьдесят лет назад при постройке плотины «Куробэ» были обнаружены два загадочных артефакта. Наука была не в состоянии объяснить их загадочные свойства, поэтому для их изучения на месте обнаружения артефактов основали научно-исследовательский институт ООН «Куробэ». Самые выдающиеся ученые мира приезжали работать в этот институт, а их дети поступали в международную школу Татэяма. В числе учеников этой школы числится и наша героиня Юкина Шираханэ — дочь главы института.А летом 2016 года в городе появляется странный самурай, который приносит за собой огромного робота «Куромукуро».

26 лет назад в одном из третьих классов средней школы была некая ученица по имени Мисаки. Она была хороша в учёбе и в спорте, красива внешностью и пользовалась популярностью в своём классе. Однако внезапно умерла. После чего её одноклассники решили до самого выпуска вести себя так, как будто она всё ещё рядом.Спустя много лет, весной 1998 года, юноша по имени Коити Сакакибара переводится в этот класс и сразу же ощущает гнетущую атмосферу, царящую среди его новых одноклассников. В особенности, его внимание привлекает красивая, но отчуждённая от остального класса Мэй Мисаки, носящая глазную повязку и постоянно что-то рисующая в одиночестве.

Добро пожаловать в Киото. Не тот привычный город в Японии, а Киото из параллельного мира, население которого состоит из людей, енотов-оборотней и тэнгу (длинноносых гоблинов из японского фольклора).Ясабуро Симогамо — немного застенчивый, третий по старшинству сын в семье енотов-оборотней. Его отец, Соитиро Симогамо, был главой киотского сообщества енотов, пока его не съели члены некоего «Клуба любителей пятницы». Ясабуро очень любит мечтать и иногда по забывчивости превращается в старшеклассницу. Не сказать, что он в семье один такой странный: его старший брат Ядзиро любит проводить время в образе лягушки, размышляя о смысле жизни в уединённых и влажных местах, Ясиро балуется своей способностью создавать электричество, а старший Яитиро дошел до ручки, участвуя в выборах на пост нового Нисэ-эмона.Ясабуро проводит свои дни в заботах о старом тэнгу, разучившимся летать, в борьбе с другими енотами-оборотнями и в играх со странной человеческой девочкой. Но случай даёт ему шанс разгадать тайну странной смерти отца...

Женщина–воин, копьеносец Бальза, странствует по городам в поисках работы. Бальза – профессиональный телохранитель. Забота об экипировке приводит ее в Його, благополучную и богатую страну. Здесь Бальза надеется всего-навсего починить сломанное копье, но неожиданно оказывается «при исполнении» - на мосту случается несчастный случай. Во время следования императорского кортежа опрокидывается повозка со вторым принцем Його, Его Высочеством Тягуму. Бальза бросается в воду за мальчиком, не предполагая, что судьба накрепко свяжет ее со спасенным ребенком...