События происходят в мире, параллельном миру «Ночи схватки», в котором Великий Грааль загадочным образом исчез из Фуюки после Третьей Войны Святого Грааля. Спустя много лет клан магов Иггдмилленния открыто заявляет о своём выходе из Ассоциации Магов и о том, что именно в их руках находится Грааль.Тем временем в городе Трифас две противоборствующие стороны сталкиваются в битве за право владеть священной реликвией. Чёрная фракция, члены которой являются магами семьи Иггдмилления, и Красная фракция — наёмники, отправленные Ассоциацией для того, чтобы вернуть Грааль. С каждой стороны выступают семь слуг и семь мастеров. Сам Грааль призывает слугу класса Рулер в качестве наблюдателя конфликта. Это знаменует начало Великой Войны Святого Грааля.

Мир был близок к полному уничтожению «Абсолютным отчаянием», который вызвал «Самое большое, самое ужасное, самое трагичное событие в истории человечества». Для того, чтобы спасти этот мир от хаоса, была сформирована группировка «Фонд Будущего». Хотя организация продолжает свою деятельность по восстановлению мира, Макото Наэги находится под подозрением в измене за защиту «Остатков отчаяния».Члены «Фонда Будущего» собрались вместе, чтобы принять решение о его наказании, но, в конечном итоге, попались в ловушку и должны принять участие в «Финальной убийственной игре» Монокумы. У участников есть странный браслет, который в определённое время выпускает усыпляющий газ. Пока все спят, предатель, находящийся среди них, убивает члена «Фонда Будущего».Чтобы выжить, они должны определить предателя и остановить убийства. Макото вынужден столкнуться с игрой смерти, где единственный выход — убить или быть убитым. История отчаяния, в которой надежда убивает надежду, начинается.

Юки Такэя влюблена в школу. По её мнению, это замечательное место, где она наслаждается школьными занятиями, и особенно работой в клубе — «Клубе школьной жизни». Президент клуба Ри, Куруми — другой член клуба, а также учитель, «сестрёнка» Мэгу, всегда рядом.Да, Юки любит школу... в своих фантазиях. На самом же деле реальную школьную жизнь и занятия в клубе невероятно трудно выстоять.