Продолжение «Драконий жемчуг Зет: Броли — Второе появление», события которого разворачиваются после Мирового турнира и игнорируют появление Бабиди в аниме-сериале «Драконий жемчуг Зет».В самый неподходящий момент Сатане бросает вызов его давний соперник детства — Барон Джагер Батта. Однако Джагер не будет сам участвовать в бою, вместо этого он использует биобойцов, одним из которых оказывается клонированный Броли.

Далёкое будущее. В Землю врезается метеорит и приносит за собой опасную форму жизни. Вирус, известный как M34, превращает людей в злобных монстров. Большая часть человеческой популяции уничтожена. Создаются государственные учреждения для борьбы с вирусом. NOA, одна из таких групп, внедряет наномашины в тела своих солдат. Эта технология позволят им трансформироваться и бороться с инфекцией. К сожалению, вирус мутирует, и NOA уже не справляется. Теперь судьба мира находится в руках шестнадцатилетней девушки Ай, Юнита И, обладающей таинственной психокинетической силой, способной противостоять вирусу.

Харука Миназуки и Аой Каназуки — две ученицы в академии St. Cherine. Харука вечно полна бурлящей энергией, тогда как Аой — держит себя по-взрослому, да и к тому же одна из лучших учениц в классе. Но, несмотря на различия между ними, они — закадычные подруги. Обе девушки ничем не отличаются от своих сверстниц — регулярно, как и все, посещают академию... но правда в том, что они скрывают маленький секрет, о котором никто не должен узнать…В течение дня они и в самом деле всего лишь ученицы в академии, но после они становятся дуэтом ангелов-близнецов и сокрушают зло, угрожающее городу!Милые ангелочки вернулись, и теперь самое время немножко размяться!

Время хаоса. Земля уже не та, что раньше. Она кишит созданиями, которых называют «синие». Юдзи Кайдо, у которого обнаруживают таинственную болезнь, вводят в искусственную комму, пока не будет найдено лекарство. Когда юноша просыпается, то узнаёт, что прошло более 20 лет с тех пор, как его поместили в анабиоз, и мир теперь контролируется этими созданиями. Впоследствии Юдзи решает присоединиться к группе солдат, сражающихся против «синих», в надежде истребить заразу и вернуть покой родной планете.

В ХХ веке между людьми и монстрами разразилась настоящая война. С тех пор, держась в тени, монстры стали повелевать миром.Мальчик по имени Бокка Серенада, изучая всё произошедшее, пытается понять, что же сталось с воинами Мелоса, отважно защищавшими мир от демонов. Вскоре он встречает Курофунэ и узнаёт о силе Мелоса. Только воины Мелоса могут видеть и слышать Мелодию Забвения — призрачную девушку, скрытую и ожидающую своего освобождения, чтобы стать спасительницей мира. В ходе битвы между Курофунэ и демоном, Бокка обнаруживает нечто невообразимое — он тоже способен слышать Мелодию!