Сатоши, Касуми и Такэши попадают в столицу воды — Альтомар. Здесь они совершенно случайно встречают Латиас и Латиоса — покемонов-хранителей сокровища «Капля сердца», о существовании которых в городе ходят легенды.Всемирно известные воровки Заннер и Лион стремятся завладеть таинственным артефактом, и их действия грозят стереть Альтомар с лица земли.

Очнувшись в незнакомом месте, герой обнаруживает, что серьёзно ранен. Он не помнит, как его зовут и чем он занимался, на его лице — маска, которую нельзя снять. Люди, спасшие его, — семья из двух девушек и старухи — принимают его в своём доме. Вскоре он решает остаться у них и жить мирно в этой небольшой деревушке.Однако мирная жизнь не продлилась долго. Одно за другим события втянули его и односельчан на путь войны за свободу.Кто он? Откуда пришёл? Куда приведёт его война с ужасным императором?

Аниме, основанное на оригинальной игре от Nintendo Покемон: Красное и Зелёное. Главные герой Ред — жизнерадостный мальчик, живущий в городе Паллет Таун региона Канто и внук знаменитого исследователя покемонов профессора Оука — Грин .Вместе им предстоит бороться с Командой R, могущественной преступной организацией, и пройти путь становления сильнейшими мастерами покемонов.