В один из летних деньков Токио содрогается от крупного террористического акта. За этим стоит некая организация, именуемая «Сфинкс» и появившаяся буквально из ниоткуда. Вот только состоит эта организация всего из двух школьников, Араты «Девять» Коконоэ и Тодзи «Двенадцать» Хисами, а также неожиданно присоединившейся к ним Лизы Мисимы. Пока все ищут злодея, эта троица делает первый ход в игре, частью которой стало всё население Японии.«В этом мире необходимо уметь спустить курок» — с этим девизом и начинается грандиозная «игра».

В Токио 2039 года, через десятилетие после охватившего страну вируса, прозванного позже «Апокалипсис», всё находится под контролем мультинациональной организации GHQ, проводящей опыты в области генной инженерии. Сю Ома — обычный школьник в переходном возрасте, с людьми не особо ладит, хотя мечтает завести друзей и перестать быть таким неудачником.Однажды он встречает Инори, участвующую в группе сопротивления «Гробовщики», члены которой пилотируют меха-оружие для борьбы с правительственным беспределом. По стечению обстоятельств в него вливается один из трёх «геномов пустоты», позволяющий использовать «силу короля» — возможность извлекать оружие и предметы из людей, силу, которая поможет изменить мир и жизнь вокруг.

Инопланетяне, также известные как óни, вторглись на Землю и обещают покинуть её при одном условии: случайно выбранный землянин должен выиграть в пятнашки один на один с Лам, прекрасной дочерью лидера захватчиков. Избранным оказался похотливый и невезучий старшеклассник Атару Моробоси. У Атару есть десять дней на то, чтобы попытаться схватить Лам за рога, но, столкнувшись с инопланетными силами девушки-óни, он понял, насколько невыполнимой является эта задача. Кажется, что для Земли всё кончено, но перспектива женитьбы на его подруге детства Синобу Миякэ смогла мотивировать юношу, и он всё-таки застал инопланетянку врасплох. Схватка окончена, планета спасена! Однако если для всех остальных это счастливый конец, то для Атару — горькое начало. Ведь Лам почему-то решила, что Атару хочет жениться на ней, и переехала к жениху. Бедный школьник постоянно пытается избавиться от навязчивой невесты, но вряд ли удача когда-либо будет на его стороне.

Во времена Бакумацу жил мечник Баттосай Убийца. От одного лишь его имени многих охватывал ужас. Но когда власть сёгуна пала, он словно растворился в воздухе, оставив в памяти людей только легенду о себе и титул сильнейшего воина Японии.Прошло время, и вот на дворе уже одиннадцатый год Мэйдзи. По улочкам старого Токио бредёт одинокий юноша с тупым клинком на поясе. Его зовут Кэнсин Химура. В городе он знакомится с юной Каору Камией, последовательницей школы меча Камия Кассин-рю. Девушка пытается выйти на след Баттосая Убийцы, который вот уже несколько месяцев орудует в городе. Кэнсин же берётся за его поиски, преследуя собственные мотивы.

Однажды в размеренную жизнь школьника-кроссдрессера Макото Ханаоки, словно вихрь, ворвалась Саки Аои, ученица на год младше него. Девушка не знала об увлечении Макото и, краснея от смущения и осознания запретности собственных чувств, призналась ему в любви.Парень давно практикует переодевание и уже привык к осуждению и косым взглядам окружающих. Поэтому, чтобы тотчас устранить недопонимание, он признался Саки в том, что он парень, а также уверил девушку, что не способен кого-то полюбить и не может ответить на её пылкие чувства. Ожидая в ответ на своё признание увидеть удивление на лице девушки, которое вскоре сменит гримаса брезгливости, Макото приготовился отчалить восвояси, но Саки удивила его! Она заявила, что его увлечение достойно восхищения и что она добьётся от него взаимности любой ценой!

После того как братья-близнецы Тор и Рай Кляйны стали свидетелями убийства родителей, неизвестные в масках переправили их на отдалённую планету, куда свозят преступников. Имея на руках только необычный нож и зловонный мешочек, они отправились на поиски цивилизации. Вскоре они выяснили, что растения на этой планете имеют преимущество перед животными. Только отдав всё, чтобы выжить, отбросив свою человечность и превратившись в зверя, каким был когда-то человек, смогут они выжить на этой жестокой планете.

Кровавая и жестокая эпоха Бакумацу длилась в Японии с 1853 по 1869 годы. Свержение сёгуната Токугава и установление власти императора сопровождалось чудовищным кровопролитием. Ценой множества оборванных жизней в Японии установился мир, но мир шаткий, равно как и власть нового руководства страны. Спокойствие в стране под угрозой из-за зловещих планов бывшего хитокири Макото Сисио, буквально восставшего из пепла и жаждущего отомстить новой власти.

Вернувшегося домой на похороны деда, тридцатилетнего холостяка Дайкичи Кавачи просто сбивает с ног шокирующее открытие: у его покойного деда есть незаконнорождённая дочь, которую родила молодая любовница. Остальные члены семьи шокированы в равной степени и возмущены таким сюрпризом — никто не хочет брать на себя ответственность опеки над маленькой молчаливой девочкой Рин Кагой. Рассерженный таким отношением, Дайкичи решает сам заботиться о девочке. Но как же у него получится воспитывать её, если он сам — всего лишь переросший подросток?

С завершением Фрактала — системы управления миром, человечество наконец-то впервые в истории добилось рая на Земле, где для жизни не надо прилагать никаких усилий. Всю рутинную работу за людей выполняют их аватары, а сами люди могут заниматься всем, чем душе угодно.Теперь, спустя тысячу лет после активации Фрактала, система все еще действует, однако в живых не осталось никого, кто бы понимал, как она работает, а обслуживающим персоналом теперь являются служители Храма, больше похожего на культ. Подавляющее большинство людей искренне верит в то, что сохранность системы — единственное, что нужно для счастливой и беззаботной жизни.Главный герой истории, парень по имени Клейн, живет обычной бесцельной жизнью. Но однажды он помогает Фрине, беглой жрице Фрактала, спрятаться от неизвестных преследователей. Впрочем, вскоре Фрина исчезает, оставив Клейну странный кулон. Клейну удается расшифровать спрятанные в нем данные и активировать кулон, который после активации превращается в девочку-аватара по имени Несса.Так Клейн и Несса отправляются в путешествие, в котором им предстоит найти Фрину, повстречать людей из группировки «Потерянное тысячелетие» и узнать правду о Фрактале.

Юта Такэмото, Такуми Маяма и Синобу Морита — три студента, которые вместе проживают в жилом комплексе и учатся в одном колледже искусств в Токио.Их привычная жизнь меняется, когда они знакомятся с Хагуми Ханамото, родственницей Сюдзи Ханамото — профессора искусств. Она приехала жить с Сюдзи и учиться в том же художественном колледже, где учатся Такэмото, Маяма и Морита. Юта с Синобу быстро влюбляются в Хагу, но если первый старается скрыть свои чувства и остаться с Хагу друзьями, то второй выражает свою любовь так, что подчас даже пугает девушку.С их компанией также общается Аюми Ямада, мастер керамики, известная под прозвищем «Железная леди», которая очень быстро находит общий язык с Хагу. Аюми подрабатывает в семейном магазинчике сакэ. Хоть Аюми и пользуется популярностью у парней, она влюблена в Такуми, не разделяющего чувств девушки и считающего её всего лишь другом. Сам же Такуми влюблён в женщину, которая на много лет старше его, — Рику Хараду, вдову и друга профессора Ханамото, работающую в архитектурной студии, которую Рика основала вместе с мужем.История показывает жизнь героев, их любовные треугольники, неразделённую любовь, окончание колледжа, поиск работы и познавание самих себя.

К 2112 году умелая и прогрессивная Япония смогла создать утопичную идеалистическую модель общества, считавшуюся философами древности недостижимой. Толчком к этому послужила замена устаревшего государственного аппарата многофункциональной системой под названием «Сивилла», на которую люди возложили ответственность за сохранение порядка и обеспечение безопасности в обществе. Введение безотказной системы с неограниченными правами способствовало снижению преступности почти до нуля. На основе данных «психопаспорта» — уникальной характеристики личности — система мгновенно определяет индивидуальный коэффициент преступности — вероятность, с которой человек может совершить преступление, указанная в числовом значении — и, если коэффициент превышает норму, беспристрастно судит его как потенциального преступника.С приходом «Сивиллы» нормализовался уровень спокойствия среди населения. Постепенно люди превратились в бесстрашную инертную массу, толпу, неспособную распознать преступление, совершаемое прямо у всех на глазах. Лишённая погрешностей система показала, что вовсе не лишена погрешностей. Её слабость, как ни странно, оказалась в людях, которых она защищает. Полностью избавиться от потенциальных преступников невозможно, и случаи насилия, хоть и редко, но будут происходить. Те, чей коэффициент преступности ненамного превышает норму, «Сивилла» отправляет на принудительное лечение, а тех, кто переступил черту безвозвратно — приговаривает к уничтожению. Поэтому система, способная только судить, нуждается в исполнителях — тех, кто готов раз за разом приводить приговор в исполнение без страха «запятнать» свой «психопаспорт», тех, кто почти переступил черту. Бюро Общественной Безопасности, куда поступает на службу молодая следователь Аканэ Цунэмори, располагает такими людьми — затравленными «псами», выученными охотиться на злобных «волков».