История разворачивается в мире, который смог достичь больших успехов в области развития технологий и компьютерных сетей, а также открыть архипелажную нацию Кремона.Вот в таких условиях обычному парню Коку, который учится изготавливать скрипки, и легендарному следователю королевской полиции RIS Киту предстоит разобраться с таинственной преступной организацией. Однако, помимо преступной группировки, городу угрожает нечто не менее страшное, а именно череда таинственных и жестоких серийных убийств, на месте которых можно обнаружить подпись убийцы «Би», чью личность, а также цель преступлений и необходимо будет раскрыть героям.
Еще одно дополнение к франшизе «Призрак в доспехах», рассказывающее о появлении Девятого отдела МВД Японии.Отдел занимается различного рода расследованиями, которые не под силу вести полиции. Мотоко Кусанаги — майор, в детстве перенесшая многочисленные операции по кибернетизации тела и ставшая полноценным киборгом — оказывается под командованием Дайсукэ Арамаки, чтобы расследовать дело о взрыве бомбы. Однако помимо нее, Арамаки привлек к делу еще одного подозрительного человека, ветерана и экс-рэйнджера, по чьей вине случилось множество различных кровавых конфликтов в Южной Америке — Бато, и детектива Тогуса. Это послужило началу формирования Девятого отдела. Вместе эта троица должна дать отпор всем террористам.
Кэтриелл Лейтон, дочь профессора Лейтона, открывает своё детективное агентство. Вместе со своим помощником Ноа Монтуаром и говорящим псом Шерлом Кэтриелл Лейтон разбирается в странных случаях, которые происходят в Лондоне каждый день. Кэтриелл начала работать с целью найти своего отца Хершела Лейтона. Но её невероятные способности разгадывать головоломки сделали девушку известной, и теперь к ней обращаются с многочисленными просьбами.
Боруто Узумаки — сын Наруто Узумаки, героя Скрытого Листа и седьмого Хокагэ. Главный герой сей истории весьма одарён, но ненавидит работу Наруто и поэтому считает его неважным отцом. Боруто считает своего отца героем, и в его сердце возникает желание превзойти героический путь отца, и лучшей идеей для этого становится намерение стать учеником человека, который знал его отца с ранних лет и являлся одновременно соперником и лучшим другом. Но что думает об этом сам Саскэ Учиха? В то время, как команда Боруто обзаведётся своим сэнсэем, Боруто будет называть учителем Саскэ. Итак, наступает новая эпоха для жизни нового поколения синоби.
